Po wyborze nowego czynnika chłodniczego przyszła pora na przeprojektowanie układu chłodniczego tj. dobór odpowiednich komponentów, w tym kształtu i długości parownika. Zespół FrostWave zdecydował się na przejście z zewnętrznego parownika (wężownicy) na parownik mikrokanałowy umieszczony wewnątrz komory. Równolegle do tych działań, podjęto kroki związane ze sposobem doprowadzenia grzania mikrofalowego do urządzenia.
Zaproponowane zostały dwie koncepcje, w których emiter fal mikrofalowych umieszczono na górnej powierzchni komory zewnętrznej oraz :
1) pozostawiono komorę wewnętrzną
2) usunięto komorę wewnętrzną a parownik oddzielono membraną
Oczywiście w wersji z grzaniem mikrofalowym nie można zapomnieć o odpowiednim doborze materiałów, z których zostanie wykonane wnętrze liofilizatora.
Koncepcje zaprezentowano na poniższym rysunku: